Reservatórios, ambientes construídos para produção de energia e abastecimento de água, são sistemas complexos, dinâmicos e sensíveis aos efeitos de atividades antropogênicas. Uma das principais consequências das ações antrópicas na bacia hidrográfica é a ocorrência do processo de eutrofização artificial decorrente do aporte excessivo de nutrientes que desencadeia o crescimento acelerado do fitoplâncton (algas e cianobactérias). Este fato é uma preocupação atual dos gestores, uma vez que a proliferação de algas nocivas pode inviabilizar os usos múltiplos dos reservatórios. A demanda pelo desenvolvimento de métodos alternativos confiáveis e precisos para quantificação de algas, em especial cianobactérias, são cada vez mais demandados pelos responsáveis pela gestão e manejo de mananciais de usos múltiplos. Para tanto, propomos a aplicação de uma metodologia alternativa (análise de pigmentos por cromatografia líquida de alta eficiência) para a quantificação de microalgas com a finalidade de agilizar o processamento das amostras ambientais e geração de resultados para os gestores dos mananciais de usos múltiplos. Amostragens de água serão realizadas em 21 mananciais do estado de São Paulo. O projeto pretende estabelecer rede de parcerias nacionais e internacionais e envolverá a participação de estudantes de graduação e pós-graduação contribuindo não só para a formação de recursos humanos como também aprimorando a capacidade técnica e cientifica institucional. Os resultados serão divulgados em eventos nacionais e internacionais e revistas científicas.